Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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