Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLDN9O95484 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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