Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
UBXN4Q92575 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms