Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FXNQ16595 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FXNQ16595 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms