Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PARP14-202ENST00000474629 7915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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HERC1Q15751 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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