Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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