Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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RFTN1Q14699 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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RFTN1Q14699 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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RFTN1Q14699 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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RFTN1Q14699 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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RFTN1Q14699 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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RFTN1Q14699 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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RFTN1Q14699 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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RFTN1Q14699 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
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RFTN1Q14699 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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