Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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