Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms