Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
BPTFQ12830 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
BPTFQ12830 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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