Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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HOXD12P35452 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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HOXD12P35452 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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HOXD12P35452 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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HOXD12P35452 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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