Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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LMOD1P29536 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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LMOD1P29536 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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LMOD1P29536 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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LMOD1P29536 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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LMOD1P29536 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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LMOD1P29536 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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LMOD1P29536 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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LMOD1P29536 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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