Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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USP18Q9UMW8 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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USP18Q9UMW8 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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