Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP3Q96P20 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms