Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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