Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PDCD1Q15116 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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