Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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ATP1A4Q13733 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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ATP1A4Q13733 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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ATP1A4Q13733 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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