Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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CDH18Q13634 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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