Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms