Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SRSF5Q13243 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms