Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NME3Q13232 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NME3Q13232 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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