Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms