Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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TRAF1Q13077 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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TRAF1Q13077 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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TRAF1Q13077 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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TRAF1Q13077 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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TRAF1Q13077 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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TRAF1Q13077 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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TRAF1Q13077 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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TRAF1Q13077 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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TRAF1Q13077 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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TRAF1Q13077 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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