Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms