Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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FOXF2Q12947 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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FOXF2Q12947 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF2Q12947 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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