Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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