Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 SMARCA1-203ENST00000371123 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL359924.1-201ENST00000450451 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC016251.1-201ENST00000624299 4198 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 NLRP5-203ENST00000621651 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 CEP63-201ENST00000332047 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TRHP20396 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 LGI1-211ENST00000630047 1751 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 HAVCR2-201ENST00000307851 2907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL359220.1-202ENST00000500036 4499 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 ZNF502-204ENST00000449836 3173 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 MYOF-201ENST00000358334 6680 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 GLS2-215ENST00000539272 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC078795.1-201ENST00000602342 3143 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TRHP20396 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC004947.1-201ENST00000420912 2781 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 OR10W1-201ENST00000395079 1469 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 DDIAS-211ENST00000533655 3533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 AL049543.1-201ENST00000499525 2874 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 PREPL-202ENST00000378511 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TRHP20396 FAM135B-204ENST00000395297 6962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms