Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms