Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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