Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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