Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
FOXQ1Q9C009 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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