Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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VPS72Q15906 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VPS72Q15906 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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