Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
JMJD1CQ15652 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms