Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms