Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL4AQ13619 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms