Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SF3B2Q13435 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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