Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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ITGB3BPQ13352 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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ITGB3BPQ13352 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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ITGB3BPQ13352 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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