Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SP140Q13342 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SP140Q13342 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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