Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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