Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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