Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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