Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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IFT88Q13099 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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IFT88Q13099 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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IFT88Q13099 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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IFT88Q13099 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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IFT88Q13099 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
IFT88Q13099 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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