Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
EPHB4P54760 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms