Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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CENPFP49454 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CENPFP49454 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CENPFP49454 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CENPFP49454 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
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CENPFP49454 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CENPFP49454 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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CENPFP49454 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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CENPFP49454 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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CENPFP49454 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CENPFP49454 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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CENPFP49454 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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CENPFP49454 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CENPFP49454 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CENPFP49454 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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CENPFP49454 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CENPFP49454 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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CENPFP49454 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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CENPFP49454 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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CENPFP49454 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CENPFP49454 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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CENPFP49454 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CENPFP49454 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CENPFP49454 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CENPFP49454 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CENPFP49454 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CENPFP49454 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CENPFP49454 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CENPFP49454 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CENPFP49454 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CENPFP49454 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CENPFP49454 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CENPFP49454 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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