Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD13P35453 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD13P35453 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD13P35453 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD13P35453 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD13P35453 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD13P35453 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD13P35453 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD13P35453 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD13P35453 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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HOXD13P35453 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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HOXD13P35453 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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HOXD13P35453 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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HOXD13P35453 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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HOXD13P35453 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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HOXD13P35453 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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HOXD13P35453 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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HOXD13P35453 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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