Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXA3O43365 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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