Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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