Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC005323.1-203ENST00000585303 566 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 IGKV6D-41-201ENST00000390271 371 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
VAMP3Q15836 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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