Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TAF1AQ15573 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms