Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SKIV2LQ15477 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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